Уверенная поступь ЛОЗОДа была прервана начавшейся Великой Отечественной войной. 22 июня 1941 года на заводе состоялся митинг, после которого 120 работников изъявили желание пойти добровольцами на фронт и в отряды народного ополчения, а 24 июня лозодовцы с почестями провожали их. В числе добровольцев на фронт ушел и секретарь партбюро ЛОЗОДа М.С.Шмелев.
В то грозное время основную тяжесть по выполнению производственных заданий взяли на себя женщины и подростки. Завод работал напряженно, и даже во время воздушных тревог рабочие не покидали свои места.
16 октября 1941 года пришло распоряжение Государственного Комитета Обороны об эвакуации ЛОЗОДа в город Аша Челябинской области. За короткий период было демонтировано все оборудование и вывезено на станцию Ликино. Под постоянной угрозой бомбежек, под холодным осенним дождем все грузилось в вагоны. В конце октября первый эшелон в составе 46-ти вагонов отправился на восток, а 11 ноября тронулся в путь второй эшелон с оборудованием, в котором эвакуировалась и большая часть рабочих завода и членов их семей.
Через месяц оба эшелона прибыли в город Аша. ЛОЗОД был включен в состав Ашинского лесохимического комбината, но на новом месте производство наладить не успели, так как враг был разбит под Москвой, и было получено указание о возвращении завода обратно.
В начале 1942 года лозодовцы вернулись в родные места. За короткий период были восстановлены заводские цехи, что позволило уже в феврале 1942 года приступить к выпуску оборонной продукции: шаров для помола пороха, спецдревесины для строительства самолетов и др.
Указом Президиума Верховного Совета СССР от 19 ноября 1942 года за самоотверженную работу по восстановлению предприятия и выпуск военной продукции группа работников во главе с директором завода В.Н.Субботиным, главным инженером А.И.Чувановым и заведующей производством А.А.Федоровой была награждена орденом Знак Почета .
На смену ушедшим мужьям, отцам и братьям в цеха ЛОЗОДа пришли десятки молодых девчат и парней. Среди них Н.А.Яшина, А.И.Кондрашова, А.Ф.Чуприкова, А.И.Комарова, Н.М.Гусева, Н.Я.Лучкина, В.О.Фролова, Е.И.Салова, М.В.Селина, Н.И.Думнова, А.А.Белова, Т.И.Бизина, В.Г.Матыцина, М.С.Шелапутин, Е.И.Павлов и многие другие.
Комсомольцы и молодежь во главе с секретарем З.А.Володиной создали десятки комсомольско-молодежных фронтовых бригад, умело организовали между ними соревнование за наивысшую производительность труда. Они работали по 12 часов в сутки, спали многие тут же, у станков, а после смены все работники завода шли на станцию Ликино разгружать вагоны. Все для фронта, все для победы! - под таким лозунгом трудились лозодовцы в те грозные годы.
О трудовом подвиге работников завода говорят строчки архивных документов: ЛОЗОД в 1943 году выполнил план по выпуску валовой продукции на 148,6 процента, по производительности труда на 138,3 процента и дал сверхплановой прибыли 7269 тысяч рублей .
За время войны Ликинский опытный завод по облагораживанию древесины неоднократно выходил победителем в социалистическом соревновании среди предприятий лесной промышленности страны, за что был награжден переходящим Красным знаменем Государственного Комитета Обороны СССР и переходящими Красными знаменами ВЦСПС и Наркомата лесной промышленности СССР. За ратные и трудовые подвиги многие работники завода награждены орденами и медалями Советского Союза.